Die St. Josef Kirche ist die Kirche des ehemaligen Kapuzinerklosters in Immenstadt im Allgäu, Bayern. Nach der Auflösung des Klosters im Jahr 1980 wurde die Kirche Eigentum der römisch-katholischen Pfarrei St. Nikolaus.

Der Bau der Kirche begann im Jahr 1654 und sie wurde am 21. Oktober 1655 durch den Konstanzer Bischof Franz Johann von Praßberg geweiht. Die Muttergottes, der heilige Franziskus und der heilige Josef wurden zu ihren Schutzpatronen erklärt. Der Baumeister des Gebäudes war Hans Mutter aus Mittelberg im Kleinwalsertal.

Im Jahr 1730 wurde an der Nordseite der Kirche eine Kapelle errichtet, die dem Heiligen Fidelis von Sigmaringen gewidmet war. Unter dieser Kapelle befand sich die Gruft der Kapuziner. Die Kirche enthält auch die Familiengruft der Grafen von Königsegg. Der Hochaltar auf der Epistelseite zeigt Graf Hugo und alle nach ihm verstorbenen Mitglieder der gräflichen Familie. Einige Grafen und Gräfinnen wurden auf besondere Weise im Inneren der Kirche begraben. Die Kinder der gräflichen Familie wurden unter der Kommunionsbank bestattet.

Die Kirche erfuhr im Laufe der Zeit mehrere bauliche Veränderungen und Umgestaltungen. Im 19. Jahrhundert wurden mehrere Altarbilder und Fresken von verschiedenen Künstlern geschaffen. Die Kirche wurde in den Jahren 1903, 1930 und zwischen 1962 und 1976 umgestaltet. Unter anderem wurde die Fideliskapelle und der Chor erweitert, die Westfassade im neubarocken Stil gestaltet, eine gewölbte Holzdecke eingezogen und Altarbilder erneuert.

Die Kirche enthält auch eine Orgel aus dem Jahr 1939 und wurde im Laufe der Jahre mit neuen Kreuzwegstationen, Beichtstühlen und anderen Elementen ausgestattet. Das Patrozinium der Kirche wird am 19. März gefeiert.