Die Pfarrkirche St. Johannes Baptist in Oberstdorf hat eine lange und bedeutende Geschichte. Der Bau der Kirche begann im Jahr 919 und sie wurde 1141 vom Augsburger Bischof Walther I. geweiht. Im Jahr 1644 erfolgte eine barocke Umgestaltung der Kirche. Seitdem steht sie im belebten Ortszentrum am Marktplatz wie ein unerschütterlicher Fels inmitten des Trubels der Gäste. Selbst ein verheerendes Feuer im Jahr 1865 konnte ihrer Beständigkeit nichts anhaben.

Nach dem Brand wurde die Kirche im neugotischen Stil wiederaufgebaut und im Jahr 1867 fertiggestellt. Die jüngste Renovierung verleiht der Kirche einen klaren und gelungenen Stil, der dem Kirchenraum und den Statuen eine besondere Bedeutung verleiht. Der 66 m hohe spitze Kirchturm, der höchste im oberen Illertal, und das große Kirchenschiff sind schon von weitem zu sehen.

Beim Betreten der Kirche gelangt der Besucher von der hektischen Außenwelt in einen mystisch abgedunkelten Bereich, der ihm Ruhe und Erholung bietet. Dort werden die Besucher von fünf Heiligen begrüßt: Sebastian, Stephanus, Nikolaus, Magnus und Leonhard. Diese Heiligen repräsentieren die Vielfalt der Menschen, die die Kirche betreten und erinnern an ihre individuellen Lebensgeschichten.

Die Pfarrkirche beherbergt etliche kostbare Werke. Zwei bemerkenswerte Schätzeseien hier erwähnt: Das kostbare Oberstdorfer Weihnachtsbild, das früher an der inneren Westwand hing, wurde in der neuen Turmkapelle mit ihren 1000 Jahre alten Mauern würdevoll platziert. Dieses beeindruckende Gemälde stammt vom Hofmaler Anton Raphael Mengs, einem der bedeutendsten Maler Europas. Es wurde 1954 von der Gemeinde durch Spendengelder erworben und strahlt eine einzigartige Farbpracht aus.

Eine weitere bemerkenswerte Skulptur ist die Marienstatue mit Kind, liebevoll bekannt als "Die schöne Oberstdorferin". Sie stand bisher auf dem rechten Seitenaltar, dem Weihnachtsaltar, wurde jedoch nun auf eine Eichensäule vorne rechts vor den Treppen zum Chorraum versetzt. Dadurch ist sie den Menschen näher und erhält die gebührende Aufmerksamkeit.

Der Hochaltar ist als Flügelaltar gestaltet, wobei geschlossen ein Bild von Jesus im Garten Gethsemane zu sehen ist. Beim Öffnen präsentiert sich die Auferstehung Christi. Die Seitenaltäre, der Pfingstaltar auf der linken Seite und der Weihnachtsaltar auf der rechten Seite, zeigen Szenen aus dem Kirchenjahr. Diese beeindruckenden Bilder wurden von Johann Baptist von Schraudolph (1808–1879), einem in Oberstdorf geborenen Kirchen- und Historienmaler, geschaffen.

Im 1. Weltkrieg und im 2. Weltkrieg wurden die Kirchenglocken vom Turm geholt und für Waffen eingeschmolzen. Nur die große Kirchenglocke wurde verschont und hängt heute noch als einzige von damals (1866) im Turm.