Die alte Klosterkirche und heutiges Münster in Mittelzell ist keine Kirche, in der man beim Eintreten von farbiger Pracht begrüßt wird, wie bei anderen Barockkirchen. Hier lässt man erst mal den großen, langen Raum auf sich wirken. Deshalb ist es hier auch ruhiger als etwa im Konstanzer Münster. Vom Eingangsbereich aus sieht man zuerst den westlichen romanischen Teil, dessen einziger Schmuck die zweifarbigen Bögen sind. Hier sollte man einen Moment bleiben, um sich an den Raum zu gewöhnen, vielleicht auch ganz vorne im Halbrund der Apsis. Für einen besseren Überblick kann man auch diskret die fünf Stufen zum Markusaltar hinaufsteigen. Während das westliche Querhaus oben noch durch eine Balkendecke abgeschlossen ist, öffnet sich der Raum im Langhaus zu einem bis zum First sichtbaren Dachstuhl. Dieser stammt aus dem 13. Jahrhundert und ist original erhalten. Dabei erinnert er entfernt an ein umgekehrtes Schiff. Die östliche Hälfte des Bauwerks, hinter dem barocken Chorgitter, ist dann eine stilistische Mischung aus verschiedenen Facetten der Baugeschichte: Etwa die von der Seite sichtbaren gotischen Fresken an der Chorwand oder die beiden barocken Tafelbilder mit Darstellungen der Insel. Dazu als moderne Elemente die Orgeln auf beiden Seiten. Das Kloster hatte seine Blütezeit im frühen Mittelalter und wurde nach einem langen Niedergang 1757 aufgehoben. Erst seit 2001 gibt es wieder klösterliches Leben auf der Insel: die von der Abtei Beuron ausgegangene Cella St. Benedikt in Niederzell. Die Mönche gestalten auch die Gottesdienste im Münster. Dreimal am Tag kann man in der Egino-Kapelle in Niederzell an ihrem Stundengebet mit Psalmengesängen teilnehmen. Der Kräutergarten zwischen der Kirche und dem Bootshafen ist der Versuch, das Buch eines Mönchs aus dem 9. Jahrhundert, mit seinen detaillierten Kräuterbeschreibungen wieder in die Praxis umzusetzen. Einen schönen Blick über einen grünen Teil der Insel hinter dem Münster hat man von der Terrasse des Hotels Inselhof, das auf die Barockzeit zurückgeht.